Indonezijos respublika – palei pusiaują išsidėsčiusi salų grandinė pagal plotą ir gyventojų skaičių yra didžiausia pietryčių Azijos šalis bei didžiausia salų šalis. Indonezija pagal gyventojų skaičių yra ketvirta pagal dydį pasaulyje. Indoneziją sudaro 17-18 tūkst. salų, iš kurių apie 6000 yra gyvenamos. Didžiausios salos – Borneo, Java, Sumatra, Sulavesis. Daugiausiai gyventojų turinčios salos yra Java, kur gyvena apie pusę šalies gyventojų, Sumatra, Borneo (jos dalis priklauso Malaizijai ir Brunėjui), Naujoji Gvinėja (jos dalis priklauso Papua Naujajai Gvinėjai) ir Sulavesis.Augalija. Dėl karšto ir drėgno klimato, geografinės padėties bei reljefo Indonezija turtinga įvairia augmenija – apie 40 tūkstančių rūšių. Išskyrus Javą ir Balį, apie 90% šalies teritorijos – miškai, kuriuose auga apie 3000 rūšių medžiai.Šiek tiek retesniuose musoniniuose miškuose auga raudonmedis, daugybė bambuko rūšių, pietryčių Indonezijoje gausu eukalipto.Gyvunija. Čia gausu dramblių, raganosių (Javoje – vienaragiai, Sumatroje – dviragiai), tigrai, orangutangai, malaizijos meškos veisiasi tik Sumatroje ir Kalimantanoje, laukinis jautis tik – Javoje ir Kalimantanoje. Taip pat Indonezijoje galime sutikti tigrų, panterų, leopardų, kengūrų, skruzdėdžių, gyvačių, krokodilų, varanų.Labai įvairi pakrantės vandenų jūrinė fauna. Jūrose veisiasi tūkstančiai rūšių dekoratyvinių ir pramoninių žuvų. Taipogi čia gausu ryklių, delfinų, jūros vėžlių. Pasitaiko ir kardažuvių, barakudų.Saugomos teritorijos. Šalyje daugiau kaip 35 nacionaliniai parkai (9,7% šalies ploto) buvo įkurti buvo įkurti tam, kad būtų išsaugota nykstanti retų rūšių gyvunija bei augalija. Daug rūšių gyvūnų (tame tarpe ir orangutangai bei raganosiai) baigia išnykti ir sutikti juos dabar galima tik draustiniuose. Į JUNESKO pasaulinio paveldo sąrašą įtraukti parkai: Udžung Kulonas (vakarinė Java, 1206 km2), Komodo (Komodo, 1817 km2),Lorentcas (vakarinė Papua, 25000 km2), taip pat projekto “Sumatros tropinių miškų paveldas“ parkai: Nacionalinis parkas Kerinči Seblatas (centrinė Sumatra, 15000 km2), Nacionalinis parkas Gunung-Lioseras (šiaurės-vakarų Sumatra, 9500 km2) ir Nacionalinis parkas Bukit Barisan Selatanas (pietinė Sumatra, 3650 km2).
Kiti gamtiniai parkai – Sibegutas (vakarinė Sumatra, 4030 km2), Tandžung Putingas (centrinis Kalimantanas, 3040 km2), Kutai (rytų Kalimantanas, 2000 km2), Meru Betiri (rytinė Java, 580 km2), Alas Purvo (pietryčių Java, 434 km2).Saugomų teritorijų statusą turi ir platus vandens draustinių tinklas.Beždžionių miškas BalyJava ugnikalniai